Всё знают, чем заняты мужчины этим летом - ортогонализируют латентные репрезентации и ищут собственные векторы нейронной ковариации, чтобы к утру объяснить 3% дисперсии поведения мыши.
Я вас предупреждал, что пропаду в июле, а сейчас поделюсь впечатлениями от первой недели Neuromatch Academy.
Это международная летняя школа по вычислительной нейробиологии для студентов старших курсов, аспирантов и ученых, которые хотят вкатиться в современные математические методы моделирования, стохастического и каузального анализа активности мозга. На данный момент это физиологический минимум для нейроученого. Я с этим работал в NYU, но тогда всё приходилось схватывать на лету (с помощью индусов на ютубе), и я давно хотел погрузиться в это во всё по-настоящему глубоко.
Я прикинулся малоимущим, поэтому вышло не так уж и дорого, ~$350 за весь месяц.
Каждый день разделен на две секции: 4 часа обучения + 4 часа работа над собственным проектом. Чтобы успевать все остальные важные в жизни вещи, я выбрал временной слот Азии, и теперь ложусь спать около 21:00 встаю в 3:00 ночи, умываюсь и подключаюсь к занятию. Заканчиваю днём в 12:00.
В первом блоке теоретический материал, перемежающимся практическими занятиями по анализу нейронов на пайтоне. Можно делать это индивидуально или вместе с одногруппниками, рядом всегда есть куратор, который проверяет и помогает с обучением. Понятное дело, что всё на английском, но несмотря на то, что почти вся моя группа китайцы или индийцы, мы отлично друг друга понимаем.
Если первые пару дней были довольно простыми, то потом без прогрева началась некоторая жесть настолько, что почти всё время в перерывах стало уходить на работу. Куратор подбодрила, мол понимает, что мы можем быть фрустрированы сейчас, но чтобы мы не переживали, потому что обычно люди ломаются и уходят на второй неделе, когда в лучшем случае понятно процентов пять. В целом, я довольно сильно устаю + приходится много заниматься тем, к чему медвуз никогда не готовил - математика и программирование, но то, что не убивает, делает нас сильнее.
Из супер приятного, что для проекта можно было выбрать из самых разных реальных баз данных, и я уговорил своих сослуживцев сделать причинный анализ влияния моторных и высших корковых центров на зрительную кору в задач принятия решения, в лучших традициях Бужаки на данных IBL. Сами данные собраны в 20-ти лабораториях по всему миру, чтобы всё было воспроизводимо (вы знаете, насколько для меня это важно), так ещё и самые лучше электроды пронизали весь мозг мыши целиком (см. картинку). По-настоящему крутой и беспрецедентный проект, который за раз уже вылился в целых две статьи Nature (тут и тут). Эти ребята сейчас несомненно мои супергерои в мире нейронаук. Посмотрим, что из этого получится.
Я не могу скинуть вам академический журнал с упражнениями и все семинары, но ловите открытые лекции по тем темам, что мы уже прошли:
1) Типы моделей в нейронауке: интро, аутро
2) Подбор модели: интро и аутро
3) Общие линейные модели: интро и аутро
4) Методы понижения размерности: интро и аутро
5) Глубокое обучение: интро и аутро
6) Аутоэнкодеры: интро и аутро
7) Общий подкаст про машинное обучение в нейронауках - ссылка
8) Обработка сигнала: интро
9) Линейные системы: интро и аутро
10)* Отдельно советую курс лекций по Computational Neuroscience от MIT - ссылка
Надеюсь, это поможет кому-то чуть ближе познакомиться с вычислительной нейробиологией, а кому-то и определится с направлением научной карьеры.
P.S. если вам интересно, могу делать такие заметки каждую неделю
